Die Ökumenekommission (Kommission II) befasst sich mit den Beziehungen zwischen der katholischen Kirche und den anderen christlichen Kirchen in Deutschland sowie mit ökumenisch-theologischen Grundfragen wie dem Kirchen- und Amtsverständnis oder ökumenischen Zielvorstellungen. Ihr Anliegen ist eine Stärkung der Ökumene auf dem Weg zur vollen sichtbaren Einheit der Kirche.
Zur Ökumenekommission gibt es eine eigene Unterkommission für die religiösen Beziehungen zum Judentum. Diese befasst sich mit allen Fragen des christlich-jüdischen Dialogs und pflegt die Beziehungen zur jüdischen Gemeinschaft in Deutschland, insbesondere zu den beiden Rabbinerkonferenzen. (DBK)