Der gebürtige Kölner begann nach seinem Abitur in Bonn mit dem Studium der Katholischen Theologie. Ein Auslandsjahr verbrachte er an der Päpstlichen Universität Gregoriana in Rom. Nach dem Abschluss in Bonn als Magister Theologiae studierte Frederik Wilczek in Koblenz Personal & Organisation mit dem Abschluss Master und befindet sich seit 2019 in Bonn im Promotionsstudium Theologie im Fach Liturgiewissenschaft. Seit dieser Zeit ist er auch Wissenschaftlicher Mitarbeiter am Seminar für Liturgiewissenschaft der Universität Bonn.
Privat engagiert sich der junge Theologe sehr im kirchlichen Bereich, vor allem in der Kölner Basilika St. Aposteln am Neumarkt. In seiner Dissertation beschäftigt sich Frederik Wilczek mit dem Kölner Priester Joseph Könn, der Pfarrer in St. Aposteln war und in der ersten Hälfte des 20. Jahrhunderts vieles auf dem Gebiet der Liturgie und der biblischen Spiritualität geleistet hat.