Der in München aufgewachsene Schmalhausen, Sohn einer Peruanerin und eines Deutschen, stand dem Kirchenbezirk Ayaviri im Süden Perus seit 2006 als Prälat vor. Schmalhausen gehört dem Orden Sodalicio de Vida Cristiana an.
Die 1971 als Gegenbewegung zur Befreiungstheologie gegründete konservative Gemeinschaft geriet unter anderem durch Vorwürfe sexuellen Missbrauchs in eigenen Reihen und dessen Vertuschung in die Schlagzeilen. Zeitweise unterstellte Papst Franziskus die Kongregation einer externen Leitung. Ein führendes Mitglied wehrte sich 2019 vor Gericht erfolgreich gegen die Gemeinschaft betreffende Anschuldigungen.