Seit 2004 arbeitet Pastoralreferent Werner Kleine in der von ihm initiierten Katholischen Citykirche Wuppertal. Außerdem ist er seit sieben Jahren Leiter der KGI Fides-Stelle Wuppertal, die Beratung und Information zum christlichen Glauben, zur Erwachsenentaufe und zum Wiedereintritt in die Kirche bietet.
Die Auseinandersetzung mit den Glaubensfragen der Menschen, vor allem dann, wenn sie Kirche und Glauben kritisieren, reizt Kleine an seinem Beruf besonders, weil jeder Mensch seine eigenen Fragen habe und es keine Antworten von der Stange geben könne. Für ihn sind Verstand und Glaube Geschwister, keine Feinde, und es gilt, den Glauben mit Vernunft zu durchdringen; denn, wer ohne Verstand glaubt, der stehe in der Gefahr, dass ihm die Pferde durchgehen.
Wenn es um die Auslegung der Schrift geht, ist es dem promovierten Neutestamentler wichtig herauszufinden, um welche konkreten Lebenssituationen es sich handelt, für die die Texte geschrieben wurden und was das für uns heute bedeutet. Es komme darauf an, dass das Wort Gottes auch heute wieder vergegenwärtigt wird, eben "Fleisch wird". – Sein Wunschtraum: Endlich so gut arabisch sprechen, dass er sich flüssig unterhalten kann.